Тогда вы можете создать командный файл start следующего содержания:
progr gnuplot plot.gnu
где файл plot.gnu содержит следующие строки:
plot "out.dat" u 1:2 wl pause -1
(см. подсказку по использованию программы gnuplot)

Не забудьте сделать файл start исполняемым
chmod +X start
Теперь, при запуске, start вызовет prog, которая, отработав, запишет out.dat

Затем запустится gnuplot и считает из файла plot команды вывода графика.

В результате, на экране появится окно с графиком, отражающим содержимое файла out.dat